ウェブ検索からこの方法を調べてやってくる人がいるので、気になって確認してみました。
Sign Out(サインアウト)という直接のメニューはありませんが、メニューバーのFaceTime>「環境設定」を開くと、下のスクリーンショットのようにメニューが現れます。
メニュー右上の「Face Time」と書いてあるスイッチをオフにするとFaceTimeがオフになり、事実上ログアウトされます。
あるいは、メニューバーのFaceTime > 「FaceTimeをオフにする」でも同じ動作になります。
以上、自分用のメモも兼ねて・・・。